中外團(tuán)隊(duì)揭示羊駝、美洲駝的起源與演變:受西班牙殖民影響
有“南美洲脊梁”之稱的安第斯山脈是重要的物種馴化搖籃之一,許多馴養(yǎng)動(dòng)物起源于此,其中包括羊駝(Vicugna pacos)和美洲駝(Lama glama)這兩個(gè)具有經(jīng)濟(jì)價(jià)值的駱駝科馴化物種。然而,科學(xué)界對(duì)羊駝和美洲駝的起源和演變?nèi)灾跎佟?/p>
國(guó)際上也存在爭(zhēng)議,基于考古或形態(tài)學(xué)的研究認(rèn)為,羊駝馴化自原駝(L. g. guanicoe)、駱馬(V. v. vicugna)、或美洲駝和駱馬的雜交,美洲駝則馴化自原駝;而基于少量分子標(biāo)記的一些研究表明羊駝馴化自駱馬,美洲駝馴化自原駝。
近日,基因組學(xué)領(lǐng)域權(quán)威雜志《基因組生物學(xué)》(Genome Biology)在線發(fā)表了由中國(guó)、英國(guó)、智利、秘魯、丹麥等國(guó)家的科學(xué)家合作完成的一項(xiàng)研究,題為“Genomic analysis of the domestication and post-Spanish conquest evolution of the llama and alpaca”。研究發(fā)現(xiàn)羊駝和美洲鴕兩個(gè)物種之間存在大范圍的不對(duì)稱基因漸滲現(xiàn)象。通過(guò)對(duì)漸滲發(fā)生時(shí)間及近期有效種群大小波動(dòng)進(jìn)行推斷,研究揭示發(fā)生于16世紀(jì)30年代的西班牙殖民南美洲事件對(duì)當(dāng)?shù)貍鹘y(tǒng)畜牧業(yè)所造成的可能影響。
中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所詹祥江研究員、英國(guó)卡迪夫大學(xué)Michael W. Bruford教授和山西農(nóng)業(yè)大學(xué)董常生教授為該論文共同通訊作者。山西農(nóng)業(yè)大學(xué)范瑞文教授、中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所博士研究生谷中如、華大基因光宣敏工程師和智利比奧比奧大學(xué)的Juan C. Marin教授為共同第一作者。

研究團(tuán)隊(duì)采集了安第斯山脈4個(gè)相關(guān)物種28個(gè)個(gè)體的血液樣品,通過(guò)對(duì)全基因組序列分析和系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建,發(fā)現(xiàn)羊駝起源于駱馬,而美洲駝則馴化自原駝。
通過(guò)對(duì)遺傳結(jié)構(gòu)和局部祖先推斷(Local Ancestry Inference)分析,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)兩個(gè)物種之間存在大范圍的不對(duì)稱基因漸滲現(xiàn)象:羊駝的基因漸滲率遠(yuǎn)高于美洲駝,羊駝中高達(dá)36%的基因組成分來(lái)自于美洲駝的漸滲,而羊駝滲入到美洲駝的基因組比例僅為5%。
強(qiáng)大的全基因組漸滲特征包括兩個(gè)物種的嗅覺受體復(fù)合物、羊駝的高血壓抗性、美洲駝的羊毛/纖維特征。美洲駝的馴化基因組特征包括雄性生殖特征,而羊駝的馴化基因組特征包括羊毛特征、嗅覺相關(guān)和缺氧適應(yīng)特征。
研究指出,這應(yīng)該是造成以往相關(guān)研究存在爭(zhēng)議的主要原因,因?yàn)榫€粒體DNA、微衛(wèi)星或Y染色體上的分子標(biāo)記無(wú)法從全基因組水平上揭示這一現(xiàn)象。
研究人員通過(guò)對(duì)兩個(gè)方向的滲入片段構(gòu)建“重組-衰減”模型,進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),漸滲發(fā)生的時(shí)間大約為500年之前,與1530年代西班牙殖民南美洲時(shí)期相吻合。
值得一提的是,羊駝和美洲駝對(duì)于安第斯地區(qū)的經(jīng)濟(jì)和生活十分重要,羊駝毛可作為優(yōu)質(zhì)毛織品的原料,美洲駝是當(dāng)?shù)氐闹饕W畜之一。
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